Le Football Club de Mâcon, plus couramment appelé FC Mâcon, est fondé en 1939 à Mâcon, en Saône-et-Loire. Le club s'inscrit progressivement dans le paysage du football bourguignon et évolue pendant plusieurs décennies dans les championnats régionaux. Son principal fait d'armes intervient à la fin des années 1950, lorsque l'équipe première parvient à atteindre pour la première fois le niveau national.
La saison 1958-1959 constitue le principal sommet de l'histoire sportive du FC Mâcon. Le club accède alors au Championnat de France Amateur (CFA) et découvre pour la première fois les compétitions nationales. Engagé dans le groupe Sud-Est, le FC Mâcon termine toutefois dernier de sa poule et retrouve la Division d'Honneur à l'issue de cette unique saison au niveau national. Cette expérience constitue néanmoins la première et, pendant plusieurs décennies, la seule apparition du club mâconnais dans les championnats nationaux.
Le FC Mâcon poursuit ensuite son parcours dans les compétitions régionales jusqu'à la fin du XXe siècle. Parallèlement, le football de l'agglomération mâconnaise connaît une importante réorganisation. En 1997, l'US Charnay et l'ASPTT Mâcon fusionnent pour former l'Entente Charnay et Mâcon 71. Cette nouvelle structure remporte notamment le championnat de Division d'Honneur de Bourgogne lors de la saison 1998-1999, tandis que le FC Mâcon termine de son côté à la sixième place du championnat régional.
