Division d'honneur : 1998-1999
Retrouvez le classement complet du championnat Division d'honneur pour la saison 1998-1999, avec les équipes engagées et les informations historiques.
Groupe Bourgogne
| Rang | Équipe | Pts | J | G | N | P | BP | BC | Diff |
| 1 | US Charnay-lès-Mâcon | 82 | 26 | 17 | 5 | 4 | 60 | 26 | 34 |
| 2 | Nevers Football | 80 | 26 | 15 | 9 | 2 | 41 | 20 | 21 |
| 3 | AJ Auxerre (D) | 72 | 26 | 13 | 7 | 6 | 47 | 33 | 14 |
| 4 | FC Chalon-sur-Saône | 65 | 26 | 12 | 3 | 11 | 41 | 29 | 12 |
| 5 | FC Sens | 63 | 26 | 10 | 7 | 9 | 47 | 32 | 15 |
| 6 | FC Mâcon | 61 | 26 | 9 | 8 | 9 | 41 | 35 | 6 |
| 7 | ALC Longvic | 60 | 26 | 9 | 7 | 10 | 38 | 42 | -4 |
| 8 | AS Decize | 59 | 26 | 7 | 12 | 7 | 54 | 44 | 10 |
| 9 | US Bourbon-Lancy | 59 | 26 | 9 | 6 | 11 | 36 | 42 | -6 |
| 10 | CSLC Chenôve | 58 | 26 | 9 | 5 | 12 | 34 | 40 | -6 |
| 11 | JO Le Creusot | 58 | 26 | 9 | 5 | 12 | 40 | 54 | -14 |
| 12 | Dijon FCO (C) | 56 | 26 | 8 | 6 | 12 | 47 | 58 | -11 |
| 13 | ASPTT Dijon | 45 | 26 | 4 | 7 | 15 | 26 | 62 | -36 |
| 14 | AS Châtenoy-le-Royal | 44 | 26 | 3 | 9 | 14 | 25 | 60 | -35 |
Groupe Franche-Comté
| Rang | Équipe | Pts | J | G | N | P | BP | BC | Diff |
| 1 | Entente Baume-L'Isle | 88 | 28 | 18 | 6 | 4 | 56 | 20 | 36 |
| 2 | Dole-Tavaux RC | 85 | 28 | 18 | 3 | 7 | 63 | 28 | 35 |
| 3 | Vesoul HSF (B) | 81 | 28 | 16 | 5 | 7 | 49 | 33 | 16 |
| 4 | AS Audincourt | 76 | 28 | 15 | 3 | 10 | 46 | 31 | 15 |
| 5 | US Pont-de-Roide | 75 | 28 | 13 | 8 | 7 | 47 | 28 | 19 |
| 6 | SCM Valdoie | 73 | 28 | 11 | 12 | 5 | 51 | 48 | 3 |
| 7 | FC Champagnole | 69 | 28 | 12 | 5 | 11 | 33 | 24 | 9 |
| 8 | USA Bletterans | 69 | 28 | 11 | 8 | 9 | 43 | 25 | 18 |
| 9 | Entente Roche-Novillars | 67 | 28 | 11 | 6 | 11 | 36 | 25 | 11 |
| 10 | US Fesches-le-Châtel | 63 | 28 | 10 | 5 | 13 | 37 | 38 | -1 |
| 11 | AS Valdahon | 62 | 28 | 9 | 7 | 12 | 32 | 43 | -11 |
| 12 | USC Vercel | 53 | 28 | 6 | 7 | 15 | 22 | 48 | -26 |
| 13 | US Fraisans | 51 | 28 | 6 | 5 | 17 | 24 | 54 | -30 |
| 14 | Bart FC | 50 | 28 | 6 | 4 | 18 | 24 | 56 | -32 |
| 15 | AS Luxeuil-les-Bains | 43 | 28 | 2 | 9 | 17 | 15 | 68 | -53 |