L’histoire du Saint-Alban Aucamville Football Club trouve ses racines dans deux clubs voisins de Haute-Garonne. En 1972, l’Union Sportive d’Aucamville crée sa section football, tandis que le football apparaît l’année suivante au sein de Saint-Alban Omnisports. Pendant plusieurs décennies, les deux structures évoluent séparément dans les championnats régionaux, avec des fortunes diverses. C’est progressivement autour de leurs équipes de jeunes que les deux clubs commencent à se rapprocher, avant d’envisager une collaboration plus étroite au début des années 2010.
Le principal essor sportif intervient du côté de Saint-Alban au cours des années 2000. Après plusieurs saisons au niveau régional, le Saint-Alban Omnisports s’impose parmi les meilleures équipes de Midi-Pyrénées. Le club remporte la Coupe de Midi-Pyrénées en 2007, puis réalise le doublé en 2008 en conservant la Coupe régionale et en remportant le championnat de Division d’Honneur. Ce titre permet à Saint-Alban d’accéder pour la première fois au CFA 2, alors cinquième niveau du football français et aujourd’hui appelé National 3. Le club dispute ensuite plusieurs saisons consécutives au niveau national.
Le rapprochement avec Aucamville se concrétise au début des années 2010. Après une première collaboration engagée notamment autour des équipes de jeunes dès 2010, les deux clubs décident de réunir leurs forces. À l’intersaison 2012, le Saint-Alban Omnisports FC et l’US Aucamville fusionnent officiellement pour former le Saint-Alban Aucamville Football Club. La nouvelle entité conserve immédiatement une équipe au niveau national et dispute le championnat de CFA 2 lors de sa première saison. La création juridique de l’association Saint-Alban Aucamville Football Club est enregistrée en avril 2012, avec une création administrative au 1er juillet de la même année.
Le nouveau club connaît cependant une période sportive plus difficile après cette fusion. Après deux saisons en CFA 2, le Saint-Alban Aucamville est relégué en Division d’Honneur à l’issue de la saison 2013-2014.
Aujourd’hui, le Saint-Alban Aucamville FC demeure un acteur important du football amateur au nord de l’agglomération toulousaine. Héritier de deux histoires sportives distinctes, le club s’est construit autour d’un projet commun réunissant les communes de Saint-Alban et d’Aucamville. Son histoire récente est marquée par le passage du Saint-Alban Omnisports au niveau national à la fin des années 2000, la fusion de 2012 et plusieurs remontées dans les championnats régionaux. Le développement du football féminin et la structuration de la formation font également partie des axes développés par le club depuis sa création.