Le Jura Sud Foot est un club de football français fondé en 1991 à la suite de la fusion de trois clubs du Haut-Jura : l’AS Moirans-en-Montagne, le CS Molinges-Chassal et l’Entente Lavans-lès-Saint-Claude-Saint-Lupicin. Cette union donne naissance à une nouvelle structure destinée à réunir les forces du football du secteur de la Petite Montagne et du Haut-Jura. Le club évolue dans un premier temps dans les championnats régionaux de Franche-Comté et connaît rapidement une progression qui va le conduire jusqu’aux compétitions nationales.
Après quelques années de développement, Jura Sud Foot franchit un premier cap majeur en 1996. Champion de Division d’Honneur de Franche-Comté, le club accède pour la première fois à un championnat national en rejoignant le CFA 2, alors cinquième niveau du football français. Cette première accession marque le début d’une présence régulière de Jura Sud dans les compétitions nationales. Le club poursuit sa progression et atteint le CFA en 2003, soit le quatrième niveau national, où il s’installe progressivement comme l’un des représentants du football jurassien.
Au fil des années 2000, Jura Sud Foot s’affirme ainsi dans le football amateur national. Le club évolue régulièrement en CFA, devenu ensuite National 2, et développe parallèlement une importante activité de formation. Son implantation dans plusieurs communes du Haut-Jura lui permet de constituer un véritable projet sportif à l’échelle du territoire. Cette identité territoriale est renforcée en 2009, lorsque Jura Sud Foot fusionne avec Saint-Claude-Val-de-Bienne, intégrant ainsi une nouvelle composante historique du football de Saint-Claude et de ses environs.
Depuis la fusion de 2009, Jura Sud Foot s’est durablement imposé dans le football amateur national, avec de nombreuses saisons disputées au quatrième niveau français, sous les appellations CFA puis National 2. Après plus de deux décennies passées dans les championnats nationaux, le club connaît toutefois un nouveau tournant en 2026 avec sa relégation en Régional 1. Cette descente met fin à une longue période de présence au niveau national et ramène Jura Sud Foot au plus haut échelon régional. L’histoire du club reste néanmoins marquée par son ascension depuis les championnats régionaux, sa première accession nationale en 1996, son installation en CFA à partir de 2003 et la fusion de 2009, qui a contribué à renforcer son implantation dans le Haut-Jura.