Fondé en 1905, le Stade Quimpérois est l'un des clubs historiques du football breton. Créé à Quimper au début du XXe siècle, il évolue pendant plusieurs décennies dans les championnats régionaux avant de s'imposer progressivement au niveau national. Le club participe notamment au Championnat de France Amateur à partir de la fin des années 1940 et connaît une première période faste dans les années 1950. Relégué au niveau régional en 1956, le Stade Quimpérois retrouve le CFA en 1962 et se rapproche progressivement du haut niveau. Cette longue implantation dans le football amateur constitue le socle sur lequel va s'appuyer l'une des plus belles périodes de l'histoire du football quimpérois.
En 1970, le Stade Quimpérois accède à la Division 2, alors que la réorganisation des championnats nationaux entraîne la création du nouveau Championnat National. Pour sa première saison à ce niveau, Quimper se maintient, avant de connaître une première relégation en Division 3 en 1972. Le club retrouve rapidement la D2 en 1974, redescend en 1975 puis remonte dès 1976. À partir du milieu des années 1970, le Stade Quimpérois s'installe ainsi parmi les principales formations de l'Ouest et devient un habitué de la deuxième division française. Après une nouvelle relégation en 1982, le club remonte immédiatement et entame une nouvelle période de stabilité au deuxième échelon national.
L'âge d'or du Stade Quimpérois intervient au milieu et à la fin des années 1980. En 1987, le club adopte le nom de Quimper Cornouaille Football Club alors qu'il évolue toujours en Division 2. Sur le plan sportif, Quimper réalise ses meilleurs classements à ce niveau avec une cinquième place dans son groupe lors de la saison 1986-1987, puis une quatrième place en 1988-1989. Le club réalise également un parcours historique en Coupe de France 1987-1988, atteignant les quarts de finale, ce qui constitue encore aujourd'hui son meilleur résultat dans la compétition. Malgré plusieurs saisons passées dans le haut du tableau de la deuxième division, le club breton ne parvient toutefois jamais à accéder à la Division 1.
Après cette période faste, le club connaît un rapide déclin sportif et financier. Relégué en Division 3 en 1990, le Quimper Cornouaille FC évolue ensuite dans les différents championnats nationaux avant de connaître de graves difficultés financières. Au milieu des années 1990, le club dépose le bilan et perd son statut professionnel ; l'équipe repart alors au niveau régional sous le nom de Stade Quimpérois 2000, en Division Supérieure Régionale. Le club parvient ensuite à reconstruire progressivement son équipe fanion et retrouve les championnats nationaux, notamment avec une accession en CFA2 en 2003 puis deux montées successives en 2007 et 2008 jusqu'au CFA. En 2011, une nouvelle étape est franchie avec la fusion entre le Quimper Cornouaille FC et l'Étoile Sportive de Kerfeunteun, qui donne naissance au Quimper Kerfeunteun Football Club. Cette fusion marque le début de l'identité actuelle du club, héritière de plus d'un siècle de football à Quimper.
NATIONAL
* 1 x Vainqueur de groupe de CFA : 1951
* 1 x Vainqueur de groupe de CFA2 : 2008
RÉGIONAL
* 10 x Champion Ligue de l'Ouest et Bretagne : 1924, 1926, 1928, 1933, 1938, 1949, 1962, 1978, 1989, 2007
* 4 x Vainqueur Coupe de l'Ouest : 1924, 1928, 1933, 1959