L'EFV est née du rapprochement de plusieurs clubs ruraux afin de maintenir une pratique du football dans des communes où il devenait difficile d'aligner des équipes dans toutes les catégories. Le club regroupe aujourd'hui notamment les secteurs de Savigny-le-Sec, Messigny-et-Vantoux, Étaules, Norges-la-Ville et plusieurs communes voisines de la Côte-d'Or.
Si l'Entente Football Villages est une organisation moderne, l'association support est beaucoup plus ancienne. Les registres administratifs indiquent une création de l'association le 23 mars 1971, à Savigny-le-Sec. À l'origine, elle correspondait au club local avant d'évoluer progressivement vers une structure intercommunale.
Au fil des années, le club a changé d'échelle pour devenir l'Entente Football Villages en 2019, réunissant les forces de plusieurs communes.
